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中國(guó)首部《中國(guó)實(shí)體瘤NTRK融合基因臨床診療專家共識(shí)》發(fā)布

發(fā)布時(shí)間:2022-08-31 17:19 文章作者:云鴻科技 瀏覽次數(shù):1209
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NTRK基因融合是用于泛癌種靶向治療重要的分子標(biāo)志物,隨著兩款泛癌種靶向藥物拉羅替尼和恩曲替尼的獲批上市,以及臨床數(shù)據(jù)卓越,NTRK基因已成為全球最火的抗癌靶點(diǎn)之一。


目前,多個(gè)癌種相關(guān)治療指南中均推薦檢測(cè)NTRK基因檢測(cè)。


8月25日,我國(guó)首部《中國(guó)實(shí)體瘤NTRK融合基因臨床診療專家共識(shí)》(以下簡(jiǎn)稱“共識(shí)”)正式發(fā)布。


NTRK融合基因治療建議、檢測(cè)方法、檢測(cè)時(shí)機(jī)、質(zhì)量控制提出共13條共識(shí)。


共識(shí)1:所有晚期成人實(shí)體瘤和兒童實(shí)體瘤患者均建議進(jìn)行NTRK融合基因檢測(cè),并且根據(jù)不同癌種的特性采取不同的檢測(cè)策略。(推薦級(jí)別:強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)2:晚期成人實(shí)體瘤和兒童實(shí)體瘤患者應(yīng)該在標(biāo)準(zhǔn)治療前或者治療期間考慮進(jìn)行NTRK融合基因檢測(cè);NTRK基因融合發(fā)生率高的局部晚期腫瘤患者應(yīng)在新輔助治療前進(jìn)行檢測(cè)。(推薦級(jí)別:強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)3:使用覆蓋NTRK基因內(nèi)含子區(qū)域的NGS DNA panel或者全外顯子組檢測(cè)作為NTRK融合基因檢測(cè)的首要手段,NGS RNA panel或者轉(zhuǎn)錄組作為NTRK融合基因檢測(cè)的重要補(bǔ)充手段。NGS RNA panel比 DNA NGS panel具有更高的靈敏性,尤其在IHC呈陽(yáng)性,DNA NGS panel檢測(cè)陰性的情況下建議RNA NGS panel確認(rèn)。在條件允許的情況下推薦同時(shí)提取FFPE切片的DNA和RNA,以達(dá)到并行開(kāi)展DNA和RNA 測(cè)序的目的。(推薦級(jí)別:強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)4:ETV6-NTRK3 FISH檢測(cè)可以作為NTRK融合基因發(fā)生率高的腫瘤的確診手段,其他類型實(shí)體瘤則不建議。檢測(cè)陽(yáng)性患者建議進(jìn)一步通過(guò)NGS檢測(cè)確認(rèn)相關(guān)結(jié)構(gòu)變異事件是否具有生物學(xué)功能。(推薦等級(jí):推薦)


共識(shí)5:RT-PCR檢測(cè)可以作為NTRK融合基因發(fā)生率高的腫瘤和在已知伴侶基因的情況下的確診手段,如:ETV6-NTRK3的NTRK融合基因。其他類型實(shí)體瘤則不合適。同時(shí)建議使用NGS檢測(cè)手段作為RT-PCR陰性患者的補(bǔ)充檢測(cè)手段。(推薦等級(jí):推薦)


共識(shí)6:pan-TRK IHC可以作為NTRK融合基因發(fā)生率較低、NTRK基因不表達(dá)且常規(guī)條件下不推薦NGS DNA panel方法的癌種初篩方法。也可以作為NGS檢測(cè)手段的復(fù)核手段。(推薦等級(jí):推薦)


共識(shí)7:按照NTRK 基因融合事件發(fā)生率、TRK蛋白生理性表達(dá)和NGS檢測(cè)普及度,建議以30%普及度作為區(qū)分普及度高低的標(biāo)準(zhǔn),分為三類腫瘤并進(jìn)行NTRK融合基因檢測(cè)。(推薦等級(jí):推薦)


共識(shí)8:建議各醫(yī)院病理科建立起NTRK檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)流程表,聯(lián)盟定期發(fā)布各癌種NGS檢測(cè)臨床意義重要性分級(jí)建議,在腫瘤精準(zhǔn)診療快速發(fā)展的過(guò)程中以NTRK融合基因檢測(cè)為標(biāo)志,積極促進(jìn)各級(jí)醫(yī)院精準(zhǔn)診療的發(fā)展。(推薦等級(jí):推薦)


共識(shí)9:各類檢測(cè)應(yīng)該在具有醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)資質(zhì)的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行,建議選擇通過(guò)如ISO15189、CAP、CLIA等權(quán)威機(jī)構(gòu)認(rèn)證的實(shí)驗(yàn)室。實(shí)驗(yàn)室需要按規(guī)范開(kāi)展NTRK室間質(zhì)控與室內(nèi)質(zhì)控。(推薦等級(jí):強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)10:通過(guò)病理質(zhì)控的FFPE腫瘤組織方可用于NTRK 融合基因檢測(cè)。在腫瘤組織獲取困難或FFPE樣本中腫瘤細(xì)胞含量不足的情況下,晚期腫瘤患者可選擇采集外周血進(jìn)行基于ctDNA的檢測(cè);一般來(lái)說(shuō)新鮮樣本是RNA檢測(cè)最佳材料,如可以獲取且確保取材含有足夠腫瘤組織/細(xì)胞的新鮮樣本,也可以用于DNA+RNA檢測(cè),但因取材經(jīng)驗(yàn)不足,可能存在取樣組織中腫瘤細(xì)胞含量不足的風(fēng)險(xiǎn);推薦活檢組織在10%福爾馬林中浸泡6-12小時(shí),手術(shù)組織浸泡24-48小時(shí)。選擇FFPE樣本做DNA和RNA NGS檢測(cè)時(shí),盡量選擇最近時(shí)間段的樣本,原則不應(yīng)超過(guò)兩年。選取的切片中需要有一定比例的腫瘤細(xì)胞,以滿足不同檢測(cè)平臺(tái)的檢測(cè)要求。一般做IHC或者FISH時(shí),至少需要50個(gè)腫瘤細(xì)胞;RT-PCR需要至少5%的腫瘤細(xì)胞;NGS檢測(cè)建議樣本的腫瘤細(xì)胞含量至少在20%以上。


如果切片中腫瘤細(xì)胞含量太少,可以考慮顯微切割等方式進(jìn)行腫瘤組織的富集。切取不同患者腫瘤樣本時(shí)應(yīng)有效清理或者更換刀片和攤片池水,避免蠟片交叉污染。


包含NTRK 融合基因的NGS DNA檢測(cè)產(chǎn)品必須注明融合基因探針覆蓋區(qū)域(包括內(nèi)含子),為盡量避免假陰性,建議選擇覆蓋區(qū)域比較完整或者同時(shí)含有NGS RNA檢測(cè)的產(chǎn)品。(推薦等級(jí):強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)11:檢測(cè)報(bào)告除了常規(guī)基本信息與質(zhì)控信息外,應(yīng)該包括樣本腫瘤細(xì)胞含量的比例、是否經(jīng)過(guò)顯微切割富集腫瘤組織及細(xì)胞、提取的DNA濃度和純度等指標(biāo)。NGS檢測(cè)報(bào)告融合陽(yáng)性需要包含斷點(diǎn)染色體位置信息、酪氨酸酶結(jié)構(gòu)域包含情況和是否框內(nèi)轉(zhuǎn)錄等信息。NGS報(bào)告中符合酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域包含和非閱讀框改變才可考慮報(bào)NTRK 融合基因,不滿足的情況下需要報(bào)NTRK融合基因。(推薦等級(jí):強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)12:不同檢測(cè)方法之間結(jié)果不一致、新發(fā)現(xiàn)融合伴侶或者融合基因結(jié)構(gòu)、復(fù)雜融合事件、未能清晰判斷是否為框內(nèi)轉(zhuǎn)錄、未能清晰是否包含完整酪氨酸酶結(jié)構(gòu)域或者多個(gè)驅(qū)動(dòng)基因陽(yáng)性等其他臨床醫(yī)生有疑問(wèn)的情況下,建議通過(guò)MTB(分子腫瘤專家委員會(huì))討論后決定下一步治療方案。(推薦等級(jí):強(qiáng)烈推薦)


共識(shí)13:建議NTRK融合基因的實(shí)體瘤患者臨床使用拉羅替尼、恩曲替尼等TRK抑制劑或者參加相關(guān)TRK抑制劑臨床試驗(yàn)。NTRK融合基因耐藥患者推薦使用NGS檢測(cè)發(fā)現(xiàn)耐藥突變,以便于判斷是否適合參加二代TRK抑制劑治療或者臨床試驗(yàn)。(推薦等級(jí):強(qiáng)烈推薦)


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