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中國首部《中國實體瘤NTRK融合基因臨床診療專家共識》發(fā)布

發(fā)布時間:2022-08-31 17:19 文章作者:云鴻科技 瀏覽次數:1006
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NTRK基因融合是用于泛癌種靶向治療重要的分子標志物,隨著兩款泛癌種靶向藥物拉羅替尼和恩曲替尼的獲批上市,以及臨床數據卓越,NTRK基因已成為全球最火的抗癌靶點之一。


目前,多個癌種相關治療指南中均推薦檢測NTRK基因檢測。


8月25日,我國首部《中國實體瘤NTRK融合基因臨床診療專家共識》(以下簡稱“共識”)正式發(fā)布。


NTRK融合基因治療建議、檢測方法、檢測時機、質量控制提出共13條共識。


共識1:所有晚期成人實體瘤和兒童實體瘤患者均建議進行NTRK融合基因檢測,并且根據不同癌種的特性采取不同的檢測策略。(推薦級別:強烈推薦)


共識2:晚期成人實體瘤和兒童實體瘤患者應該在標準治療前或者治療期間考慮進行NTRK融合基因檢測;NTRK基因融合發(fā)生率高的局部晚期腫瘤患者應在新輔助治療前進行檢測。(推薦級別:強烈推薦)


共識3:使用覆蓋NTRK基因內含子區(qū)域的NGS DNA panel或者全外顯子組檢測作為NTRK融合基因檢測的首要手段,NGS RNA panel或者轉錄組作為NTRK融合基因檢測的重要補充手段。NGS RNA panel比 DNA NGS panel具有更高的靈敏性,尤其在IHC呈陽性,DNA NGS panel檢測陰性的情況下建議RNA NGS panel確認。在條件允許的情況下推薦同時提取FFPE切片的DNA和RNA,以達到并行開展DNA和RNA 測序的目的。(推薦級別:強烈推薦)


共識4:ETV6-NTRK3 FISH檢測可以作為NTRK融合基因發(fā)生率高的腫瘤的確診手段,其他類型實體瘤則不建議。檢測陽性患者建議進一步通過NGS檢測確認相關結構變異事件是否具有生物學功能。(推薦等級:推薦)


共識5:RT-PCR檢測可以作為NTRK融合基因發(fā)生率高的腫瘤和在已知伴侶基因的情況下的確診手段,如:ETV6-NTRK3的NTRK融合基因。其他類型實體瘤則不合適。同時建議使用NGS檢測手段作為RT-PCR陰性患者的補充檢測手段。(推薦等級:推薦)


共識6:pan-TRK IHC可以作為NTRK融合基因發(fā)生率較低、NTRK基因不表達且常規(guī)條件下不推薦NGS DNA panel方法的癌種初篩方法。也可以作為NGS檢測手段的復核手段。(推薦等級:推薦)


共識7:按照NTRK 基因融合事件發(fā)生率、TRK蛋白生理性表達和NGS檢測普及度,建議以30%普及度作為區(qū)分普及度高低的標準,分為三類腫瘤并進行NTRK融合基因檢測。(推薦等級:推薦)


共識8:建議各醫(yī)院病理科建立起NTRK檢測的標準流程表,聯(lián)盟定期發(fā)布各癌種NGS檢測臨床意義重要性分級建議,在腫瘤精準診療快速發(fā)展的過程中以NTRK融合基因檢測為標志,積極促進各級醫(yī)院精準診療的發(fā)展。(推薦等級:推薦)


共識9:各類檢測應該在具有醫(yī)學檢驗資質的實驗室中進行,建議選擇通過如ISO15189、CAP、CLIA等權威機構認證的實驗室。實驗室需要按規(guī)范開展NTRK室間質控與室內質控。(推薦等級:強烈推薦)


共識10:通過病理質控的FFPE腫瘤組織方可用于NTRK 融合基因檢測。在腫瘤組織獲取困難或FFPE樣本中腫瘤細胞含量不足的情況下,晚期腫瘤患者可選擇采集外周血進行基于ctDNA的檢測;一般來說新鮮樣本是RNA檢測最佳材料,如可以獲取且確保取材含有足夠腫瘤組織/細胞的新鮮樣本,也可以用于DNA+RNA檢測,但因取材經驗不足,可能存在取樣組織中腫瘤細胞含量不足的風險;推薦活檢組織在10%福爾馬林中浸泡6-12小時,手術組織浸泡24-48小時。選擇FFPE樣本做DNA和RNA NGS檢測時,盡量選擇最近時間段的樣本,原則不應超過兩年。選取的切片中需要有一定比例的腫瘤細胞,以滿足不同檢測平臺的檢測要求。一般做IHC或者FISH時,至少需要50個腫瘤細胞;RT-PCR需要至少5%的腫瘤細胞;NGS檢測建議樣本的腫瘤細胞含量至少在20%以上。


如果切片中腫瘤細胞含量太少,可以考慮顯微切割等方式進行腫瘤組織的富集。切取不同患者腫瘤樣本時應有效清理或者更換刀片和攤片池水,避免蠟片交叉污染。


包含NTRK 融合基因的NGS DNA檢測產品必須注明融合基因探針覆蓋區(qū)域(包括內含子),為盡量避免假陰性,建議選擇覆蓋區(qū)域比較完整或者同時含有NGS RNA檢測的產品。(推薦等級:強烈推薦)


共識11:檢測報告除了常規(guī)基本信息與質控信息外,應該包括樣本腫瘤細胞含量的比例、是否經過顯微切割富集腫瘤組織及細胞、提取的DNA濃度和純度等指標。NGS檢測報告融合陽性需要包含斷點染色體位置信息、酪氨酸酶結構域包含情況和是否框內轉錄等信息。NGS報告中符合酪氨酸激酶結構域包含和非閱讀框改變才可考慮報NTRK 融合基因,不滿足的情況下需要報NTRK融合基因。(推薦等級:強烈推薦)


共識12:不同檢測方法之間結果不一致、新發(fā)現(xiàn)融合伴侶或者融合基因結構、復雜融合事件、未能清晰判斷是否為框內轉錄、未能清晰是否包含完整酪氨酸酶結構域或者多個驅動基因陽性等其他臨床醫(yī)生有疑問的情況下,建議通過MTB(分子腫瘤專家委員會)討論后決定下一步治療方案。(推薦等級:強烈推薦)


共識13:建議NTRK融合基因的實體瘤患者臨床使用拉羅替尼、恩曲替尼等TRK抑制劑或者參加相關TRK抑制劑臨床試驗。NTRK融合基因耐藥患者推薦使用NGS檢測發(fā)現(xiàn)耐藥突變,以便于判斷是否適合參加二代TRK抑制劑治療或者臨床試驗。(推薦等級:強烈推薦)


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